四川的各派各系军人联合驱逐滇黔军时，曾在重庆成立联合办事处，推第二军军长刘湘为处长，第一军军长但懋辛，第三军军长刘成勋为副处长。这个联合办事处长其实就是督军或者总司令。
一九二零年十二月十日，四川军人在重庆开了一个军事会议，在会议中作出了四川自治的决定，这个决定由全体川军将领署名公布。四川是继湖南之后第二个宣布自治的省份。
将滇黔军从四川赶出，在北京政府看来，也就表示四川已摆脱西南的势力范围，于是发表了刘存厚为四川督军，熊克武为四川省长，但遭拒绝。熊克武通电拒绝接受省长，全体川军将领也联名通电否认北京政府对四川的人事命令。
迫于形势，投向北方的刘存厚也不敢接受督军任命，只能赞成自治，在成都挂起了筹备自治的招牌。
不过，他打了一个密电到北京，表示自己始终拥护“中央”，由于目前四川环境特殊，所以不能公开表示态度，请“中央”予以谅解。
北京政府在四川碰了钉子，很没面子，竟把刘存厚的密电公布出来，借以遮羞。这一来刘存厚变成川人之敌，大家都骂刘口是心非，小人一个。
刘存厚怎么也没想到北京政府会如此待他的，除了打电报到北京，埋怨北京政府不该把他的密电公开，使他无地自容之外，也无之奈何。
此前，刘存厚曾收买刘湘的部下，以军长职务为饵，引诱刘湘的部下第二师师长陈能芳倒戈。结果被刘湘发现，陈能芳被撤职。而在唐继尧还未下台时，刘存厚曾派周扬前往昆明，劝唐反攻四川，自己愿为内应。周扬经过嘉定时，被第八师师长张体乾捕获，搜出刘存厚的亲笔信和秘电本，把周扬移送在重庆的“联合办事处”处理。
这一连串的事件加到一起，彻底激怒川军一二两军的将领们，他们联名斥责刘存厚“阻挠自治，倾心北廷，包办选举，自居督军，扩充军队”，并决定第一军担任北路，第二军担任东路，两路会攻成都。
“联合军”要取成都，刘存厚所属的边防军司令赖心辉首先倒戈，由保宁开往潼川，绵阳来会合北路军。刘存厚所属的陈国栋、唐廷牧两师长也派人与刘湘联络，邓锡侯、田颂尧两师长则采取了观望的态度。
面对众叛亲离、土崩瓦解的局势，三月十二日刘存厚在成都被迫通电下野，退出成都，带着他的部众万余人退到陕南宁羌一带。
联合军开进了简阳、新都，对于退往新繁、彭县的邓锡侯、田颂尧两师采取了和平办法，进行了吸收改编。
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