蔡元培的回答是；“元培亦对四万万人之代表而辞职。”
袁世凯未必不是真心挽留，但蔡元培则是铁了心求去。
毫无疑问，蔡元培若留在教育总长任上，完全可以大施拳脚，继续他的教育救国理想。但是，因为党见和政见而离开，不能不令人惋惜。
有人曾惋惜地责备说蔡元培此举，是“闹党见而不顾及国家”。蔡元培则发表《答客问》而陈述原委。
7月底，蔡元培离京去沪。10余日后，发生了首义元勋张振武及随员方维未经审判便被袁世凯杀害的骇人事件；随后，社会党首领江亢虎又在汉口被无理拘捕。为声讨和制止这些与民主共和体制极不想容的，破坏法制，蹂躏人权的事件，蔡元培和吴稚晖等十余人，发起和组织法律维持会，致电参议院，要求追究当局的法律责任。
进入民国以后，蔡元培活跃于政坛和文化教育界，因故或不愿在这个表演舞台时，他便远走海外，息影于欧洲腹地。这几乎成了他个人生涯的“周期性”现象。
还在蔡元培做教育总长时，曾接到莱比锡大学教授兰普莱西的一封信。请他派遣两名中国留学生参加他主持的世界文明史研究所进行合作研究。蔡元培通过教育部已经确定了公费名额，也正着手人员的选定，只是因为他辞职而没能很快完成。
离开教育部后，他想到了这两个留学名额，又萌生了继续留学深造的想法。恰巧他的好友顾孟余也有此意，蔡元培于是致函接替他主持教育部工作的范源濂，很快得到批准。
于是，1912年的9月，蔡元培偕夫人和子女，与顾孟余夫妇同乘奥地利“阿非利加”号客轮，由海路驶抵德国。
兰普莱西教授急需中国方面的资料，正等得着急，只不过没有想到，来的人是中国的前教育总长。
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