刘毅伏诛的消息传到了建康，监太尉诸葛长民正在屋子里静坐研习书法。近来他经常心神不定，出现幻觉，有时看见柱子上缠着一条蛇，狰狞可怖的蛇头清晰可见，他急忙叫下人用刀去砍，但蛇头消失了，下人一走，蛇头又冒出来了。有时他看见墙中伸出一只巨手，他又叫人去砍，巨手又不见了。
他怀疑自己是不是做噩梦了，于是和别人说话，声音清晰，问答条理。他也不知道自己这是怎么了。
太尉刘裕处理完刘毅的事情，心事重重地从江陵东下，准备返回建康。刘毅积攒的大批的军用物资也准备一起运送回去，由于事务繁杂有待处理，刘裕一直不能启程回京。
诸葛长民与公卿们每天都到新亭去翘首企盼，等候迎接功勋卓著的太尉凯旋归来。可是一连几天都见不到刘裕的人影，诸葛长民焦灼不安的情绪日甚一日。
二月三十日的晚上，刘裕突然乘快速小艇急速行驶，乘着夜色的掩护，神不知鬼不觉地回到了东府。次日凌晨，诸葛长民才得到消息，大吃一惊，急急忙忙去往东府晋见。
诸葛长民也是刘裕集团的元老之一，他对书法颇有造诣，行书和草书都写得很漂亮。成功反杀刁逵后，被授宣城太守。桓玄死后，受封新淦县公，都督淮北诸军事。曾击退慕容超一次入侵，升青州都督。卢循之乱时，保卫建康有功，迁豫州都督。刘毅叛乱时，出任太尉府监事，由于文武兼修，常把自己比做足智多谋功勋卓著的韩信。于是自我膨胀，妄行不法，骄横放纵、贪婪奢侈，众人颇有微词。
由于一直交往密切，刘裕对他信任有加。去江陵收捕刘毅时，还把老母和幼子交给他照顾。但诸葛长民却常常担心刘裕要查处他。
因为他知道，刘裕之所以能异军突起人望日隆，靠的就是廉洁自守、纪律严明、嫉恶如仇，如今自己不知不觉就走到了刘裕的对立面。这是一种深层次的不可调和的矛盾。如果刘裕放任近在眼前的诸葛长民恣意妄为，将没有办法管理其他人奉公守法，好不容易树立起来的威信将大打折扣。
特别是刘毅被杀，诸葛长民如坐针毡，常自言自语道：“前年杀彭越，今年杀韩信，我的大祸就要来了！
诸葛长民的弟弟，辅国大将军诸葛黎民劝说诸葛长民道：“刘毅的今天就是我们的明天，应该趁着刘裕还没有回来，抢先动手。”
诸葛长民犹豫再三，没有行动，叹息道：“贫贱的时候，常常想着富贵，现在大富大贵了，想要回去当个普通老百姓，也不能够了！”
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